По благословению Святейшего Патриарха Алексия II митрополит Кирилл посетил следующие епархии Русской Православной Церкви, где встречался с епархиальными архиереями, духовенством, местными властями и общественностью, разъяснял позицию Русской Православной Церкви по церковно-государственным и церковно-общественным вопросам, а также в связи с межхристианскими контактами и миротворческой деятельностью Русской Православной Церкви:
- Анадырскую (2005 г.)
- Аргентинскую (1997, 2006 гг.)
- Астраханскую (2005 г.)
- Брюссельскую (неоднократно)
- Венгерскую (многократно)
- Виленскую и Литовскую (1997 г.)
- Владивостокскую (2000 г.)
- Владимирскую (1990 г.)
- Волгоградскую (1999 г.)
- Вятскую (1998 г.)
- Екатеринбургскую (2001, 2005 гг.)
- Екатеринодарскую (2005, 2006 гг.)
- Житомирскую (1994 г.)
- Иваново-Вознесенскую (2002 г.)
- Кемеровскую (1993, 2003 гг.)
- Киевскую (неоднократно)
- Кишиневскую (2000, 2002 гг.)
- Корсунскую (неоднократно)
- Костромскую (2002, 2007 гг.)
- Курскую (2004 г.)
- Луцкую (1990 г.)
- Магаданскую (1993 г.)
- Майкопскую (1996, 2005 гг.)
- Нижегородскую (1996, 2003, 2004 гг.)
- Омскую (1993 г.)
- Оренбургскую (2007 г.)
- Орловскую (2000 г.)
- Пермскую (2007 г.)
- Петропавловскую и Камчатскую (2005 г.)
- Ровенскую (1990 г.)
- Ростовскую (2003 г.)
- Рязанскую (1993 г.)
- Самарскую (2008 г.)
- Санкт-Петербургскую (неоднократно)
- Саранскую (1998, 2001, 2002, 2005 гг.)
- Саратовскую (2004 г.)
- Сурожскую (неоднократно)
- Сыктывкарскую (1999, 2005 гг.)
- Тернопольскую (1990 г.)
- Тульскую (2002 г.)
- Хабаровскую (2000 г.)
- Черниговскую (1990 г.)
- Читинскую (2004 г.)
- Элистинскую (2002, 2007 гг.)
- Якутскую (1993 г.)
- Ярославскую (2005 г.)