За 1990-2000 гг. Русская Церковь стала мощной общественной силой, с которой приходилось считаться всем участникам общественно-политического процесса. Однако не все были готовы примириться с появлением нравственно ориентированной общественной силы — против Церкви была развязана клеветническая кампания в ряде СМИ, не гнушавшихся заказными материалами. Осенью 1991 г. Священный Синод с горечью констатировал:
«В стране происходит эскалация злобы. Впитав образ "тоталитарного" мышления, люди обвиняют, проклинают, унижают друг друга, клевещут друг на друга… Представителей Церкви голословно обвиняют в ереси, в поддержке ГКЧП, в сотрудничестве со спецслужбами, чуть ли не в "удушении Церкви"».
Главным объектом этой кампании наряду с Патриархом Алексием стал митрополит Кирилл, которому посвящались целые полосы с псевдоразоблачительными материалами в прессе (в 1995-2007 гг. вышло около 200 публикаций).
3 октября 1997 г. газетная кампания против Церкви была осуждена Священным Синодом Русской Православной Церкви, принявшим специальное определение по наиболее активным участникам антицерковной акции — газетам «Московский комсомолец» и «Русь православная» (приложение к «Советской России»). В определении было выражено «сожаление в связи с появлением в означенных газетах публикаций, содержащих крайне предвзятую интерпретацию церковной истории, распространяющих заведомую ложь и клевету, а в ряде случаев основанных на прямом подлоге». Синод констатировал, что газеты «Московский комсомолец» и «Русь православная» «продолжают борьбу против Церкви, которая ранее велась под знаменем государственного атеизма, а теперь дерзостно прикрывается ложно понятой "заботой" о состоянии церковной жизни».